纳豆菌是嗜氧菌，因此大豆最好是摆盘，薄厚不适合太厚，一般控制在2~3层黄豆即1cm上下。控温下2天既有結果，时间长则纳豆菌总数愈多自然异味也显著，因此最好是把保温箱体放到对外开放的生活阳台为宜。

后熟(活菌超低温休眠状态)在38-42℃的控温下发醇进行后，随后放到电冰箱内超低温熟折数小时后，搞好的纳豆不论是外型還是口味都会更好。因而建议纳豆搞好后，先放进电冰箱内超低温熟折数钟头之后再服用或长期性储存。

300g大豆泡出去有有满满的一锅(小火锅)，初次自做最好是份量递减以防不成功消耗，150克也是有1个小便当盒的量了。