黄连始载于《神农本草经》，列为上品黄连的炮制作用。《名医别录》载：“黄连生巫阳（今四川省巫山县）川谷及蜀郡（今四川省雅安境内）、太山。二月、八月采。”可见自古以来即以四川为主产地。《新修本草》载：“蜀道者粗大节平，味极浓苦，疗渴为最；江东者节如连珠，疗痢大善。今澧州（今湖南澧县）者更胜。”《本草纲目》载：“今虽吴、蜀皆有，惟以雅州、眉州者为良。药物之兴废不同如此。大抵有二种：一种根粗无毛有珠，如鹰鸡爪形而坚实，色深黄；一种无珠多毛而中虚，黄色稍淡。各有所宜。”据产地、药物形状及性味来看，《本草纲目》所载前一种即今之“味连”，原植物为黄连Coptis chinensis Franch.；后一种即今之“雅连”，原植物为三角叶黄连C．deltoidea C．Y．Cheng et Hsiao；而《新修本草》所云产江东，节如连珠者即华东一带所产的“土黄连”，其原植物为短萼黄连C．chinensis Franch. var．brevisepala W．T．Wang et Hsiao，《植物名实图考》载：“黄连，今用川产，其江西山中所产者，谓之土黄连。”从其附图的叶形可以确定为短萼黄连。

　　【化学研究】

　　根茎含多种异喹啉类生物碱，以小檗碱含量最高，为5～8%，尚含黄连碱、甲基黄连碱、巴马亭、药根碱、表小檗碱及木兰花碱等；酸性成分有阿魏酸，氯原酸等黄连的炮制作用。须根含小檗碱可达5%；黄连叶含小檗碱1.4%～2.9%。

　　【药理研究】

　　抗病原微生物作用

　　抗菌作用 金黄色葡萄球菌、溶血性链球菌、肺炎球菌、脑膜炎双球菌、痢疾杆菌、炭疽杆菌等黄连的炮制作用。

　　抗病毒作用 抑制流感病毒、乙肝病毒等黄连的炮制作用。