(2)稀有类稀有种群有重特大的科学研究使用价值，为在我国关键的当然微生物可运用資源。例如腹牛肝菌属(Gastroboletus)、红菇属(Russula)、鹅膏属(Amanita)、轴腹菌属(Hydanangi-urn)、鸡纵菌属(Termi tomyces spp)。

这种稀有物种有30多种多样大多数归属于单型种，我国独有独特种属，地区性遍布意味着种群，变成演变中的孑遗或残遗种，对生态环境保护植物群落修复具备关键的分子生物学和生物学实际意义。人工服务种植虽然有取得成功的报导，但只闻其名，销售市场看不到其货，价钱仍处贵位。

如羊肚菌、牛肝菌、红菇、绣球菌、白参菌、鸡纵菌等虽然有报导种植取得成功，但销售市场商品急缺，目前价钱为，羊肚菌干片1 500-3000元/Kg，红菇干片400元/Kg，鸡纵菌生鲜15零元/Kg，因而依然是稳坐"珍"位。

(3)稀缺类关键指的依靠纯天然天然的的树木外生菌根菌和与昆虫类相互依存的种群。例如块菌、松茸菌、牛肝菌、鸡土5L菌、红菇、虎奶菇、紫丁香蘑、鸡油菌、松乳菇、奥德蘑(水鸡纵)、绣球菌、青头菌、珊瑚菌、黄柄鸡油菌(音响喇叭菌)、梭柄乳头菇(老人头)等。这种稀有种类商品数量非常少。《我国服用茼统计年鉴))2007年统计数据显示信息:全国性松茸菌生产量仅有1 535吨，牛肝菌16172吨，羊肚菌1082吨。这三种商品总数为18789吨，仅占目录统计分析的食用菌菌种27个种类总产值。682万吨级的0.11%，生产量极其稀缺，身家非凡。因而，针对茵根性和虫类性天然的食用菌菌种的人工服务培养，完成可持续运用，一直是全球的难点和自主创新科学研究的聚焦点。