1.小动物组织或是动物药材不宜磨粉。特别是在一些自身易被微生物菌种环境污染的药，如桑螵蛸，是小动物卵鞘，带有微生物，最好是经煎制高温消毒后服食。

2.有毒副作用的中药材不宜磨粉，这种药打粉后因混和不均，造成 没法精确控制每一次服食的量。打粉后可能致药力提高，毒副作用也随着扩大。比如，全虫具备通脉止疼的作用，泡服需3~6克，而研末吞食每一次只需0.6~1克。

3.含挥发油的中药材磨粉要留意破碎机溫度，如枳壳、肉豆蔻、香薄荷等，破碎机在高速运转全过程中溫度较高，可能造成 成分挥发油的挥发，应采用短期内数次破碎的方法，尽可能减少破碎机工作温度，降低挥发油的挥发。

4.粘性重糖份高的中药材磨粉要留意干躁，如熟地、枸杞等，易受潮变软发黏，应冷冻干燥充足。要不然易黏附在家用磨粉机内腔，影响药面的粒度。

5.磨粉中药材需储存在干躁自然通风的地区，存储不必超出2年。也可密封性好后放进冷藏室，但不适合時间太长，以防药面受潮霉变，影响药力。