用量过大会发生严重的口腔炎、咽喉炎、剧烈腹泻、肠壁腐蚀糜烂、便血、急性肾功能衰竭、紫绀、血压下降、休克，甚至死亡巴豆的副作用。服用巴豆油1/4滴即可见剧烈腹泻，服0.5～1滴即有严重症状。

巴豆对皮肤粘膜及 消化道均有强烈刺激作用，对肠肌有兴奋作用，可产生剧烈腹泻，并有催吐作用巴豆的副作用。如在加工中接触已去壳巴豆、巴豆霜、巴豆油，甚至蒸煮巴豆的蒸气，都可产生急性损害，出现皮肤水肿、水疱、眼鼻灼热感、流泪、发炎。

巴豆有剧毒，临床使用宜慎重，一般可先用其它药物，如非用巴豆，应辨明确属寒实便结方可投用，中病即止巴豆的副作用。临床上将巴豆当做一般泻药，泛用于大便秘结者，都可能造成损害。