再特异性地与胃液代谢的最后阶段—质子泵(即HtK ATP酶)上的巯基以化学键融合，使其缺失泌酸作用。用以十二指肠溃疡、胃溃疡、返流性食管炎和卓-艾综合征，非常是用以溃疡伴流血、呕吐或不可以进餐及其反复性溃疡和急性胰腺炎。还可用以防止大手术治疗或比较严重创伤造成的应激性溃疡。[2]

泮托拉唑为泮托拉唑的醋酸盐，功效与泮托拉唑同样。泮托拉唑为第三代质子泵抑制药，替代性地功效于胃粘膜壁细胞，抑止壁细胞中H，K-ATP酶的特异性，使壁细胞内的H不可以装运到胃中，进而抑制胃酸的代谢。泮托拉唑在弱酸性自然环境中比类似药品更加平稳，被激话后仅与质子泵上活性位置2个结构域融合（而奥美拉唑、兰索拉唑则显示信息大量的与活性位置2个结构域融合），从分子结构水准上反映出与质子泵融合的高宽比可选择性。